Caratteristiche

• Rilevamento precoce della recidiva imminente

• Rilevazione di rapporti di target di chimerismo dal 0,05% fino al 12,5% 

• Eseguito su sistemi qPCR

Dopo la genotipizzazione iniziale, Mentype® DIPquant fornisce una diagnostica del chimerismo sensibile, adatta a rilevare piccoli cambiamenti nello stato di chimerismo di un paziente. Pertanto, può indicare una recidiva precocemente rispetto ad altri metodi meno sensibili. Mentype® DIPquant consente una quantificazione del chimerismo altamente sensibile nei casi in cui il DNA non sia un fattore limitante. Se la quantità di DNA è limitata, è possibile effettuare il rilevamento semi-quantitativo dell’attecchimento del trapianto con il kit Mentype® DIPscreen. La combinazione di Mentype® DIPscreen e Mentype® DIPquant copre quindi tutte le esigenze per l'analisi routinarie del chimerismo.

È importante analizzare il chimerismo molecolare dopo il trapianto allogenico di midollo osseo e di cellule staminali per monitorare l'attecchimento del trapianto o per rilevare un imminente rigetto del trapianto in una fase precoce. L'analisi del chimerismo molecolare viene effettuata rilevando polimorfismi di delezione/inserzione, che sono particolarmente adatti per l'analisi tramite qPCR allele-specifico rispetto ad altri strumenti.

Dopo l'identificazione dei loci DIP informativi per il paziente e il donatore tramite il kit Mentype® DIPscreen, l'analisi quantitativa del chimerismo può essere eseguita con i saggi singleplex Mentype® DIPquant. Questi saggi offrono un formato flessibile, ideale sia per l'analisi di singoli campioni sia per grandi quantità di campione, garantendo un dispendio minimo di materiale. Tuttavia, a causa dell'elevata sensibilità del metodo qPCR, che può comportare riduzione della precisione nell'analisi del chimerismo misto, è raccomandato l'utilizzo del kit Mentype® DIPscreen per campioni con una significativa componente di chimerismo misto.

Caratteristiche

Favorisce l'analisi dei dati per i kit di chimerismo BIOTYPE.

Supporta l'identificazione dei marcatori informativi.

Automatizza l'analisi del chimerismo dalla genotipizzazione preTx al monitoraggio postTx.

Costruisce un database per la gestione dei risultati.

Riporta i valori di chimerismo come report PDF e permette l’esportazione in formato CSV.

ChimerisMonitor è il software per l'analisi del chimerismo che unisce velocità e precisione con un'interfaccia intuitiva e personalizzabile. Il software gestisce l'intero processo di analisi dei campioni nel campo del chimerismo, dall'iniziale genotipizzazione fino alla quantificazione altamente sensibile delle cellule residue del donatore o del ricevente. Rileva automaticamente i segnali del donatore e del ricevente, classificando i loci identificati in base al loro grado di informatività. Calcola la percentuale di chimerismo per diversi campioni e determina la deviazione standard di ciascuna analisi. I risultati ottenuti sono presentati in un report dettagliato che garantisce chiarezza e fornisce una panoramica completa, particolarmente utile negli studi longitudinali.

Caratteristiche

• Elevato potere discriminante.
• Basso input di DNA per alta sensibilità ≥ 2 %.
• Consente genotipizzazione e monitoraggio ad alto rendimento.

Mentype® DIPscreen è la soluzione ideale per iniziare l'analisi del chimerismo in modo efficiente ed economico. Il kit è progettato per la genotipizzazione iniziale dei campioni di riceventi e donatori e per il monitoraggio routinario del chimerismo, offrendo una sensibilità fino al 2%. Per una quantificazione del chimerismo ancora più precisa, è possibile utilizzare i saggi qPCR Mentype® DIPquant o il kit digital PCR Mentype® DigitalQuant (RUO). Questi approcci combinati offrono un monitoraggio del chimerismo flessibile e affidabile, adattandosi perfettamente alle vostre esigenze.

L'analisi molecolare del chimerismo in seguito a un trapianto di cellule staminali allogeniche è ormai un metodo consolidato per monitorare l’andamento dell'attecchimento del trapianto e valutare il rischio di recidiva. Questa analisi può essere eseguita su diverse sequenze di DNA, tra cui i polimorfismi biallelici di breve inserzione/delezione (DIPs, INDELs) che presentano vantaggi significativi. L'amplificazione dei marcatori DIP mediante polimerasi non genera picchi “stutter” potrebbero compromettere la chiarezza dell'analisi. Inoltre, questi polimorfismi sono particolarmente adatti per approcci quantitativi allele-specifici. Mentype® DIPscreen è un'analisi del chimerismo basata su DIP, garantendo una chiara differenziazione tra donatore e ricevente, garantendo un monitoraggio del chimerismo altamente preciso.

Biomarkers

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FAM-Panel

DIP Locus: AM X, AM Y, HLD106, HLD70, HLD84, HLD103, HLD104, HLD116, HLD112, HLD307, HLD310, HLD110, HLD133, HLD79, HLD105,HLD140, HLD163

Localizzazione cromosomica: Xp22.1-22.3, Yp11.2, 16q13, 6q16.1, 8q24.12, 12q23.1, 13q32.1, 18p11.22, 17p12, Xp11.23, 2p22.3, 16q22.1, 3p22.1, 7q31.2, 14q24.3, 3q23, 12q24.31

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BTG Panel

DIP Locus: HLD91, HLD23, HLD88, HLD101, HLD67, HLD301, HLD53, HLD97, HLD152, HLD128, HLD134, HLD305

Localizzazione cromosomica:11q14.1, 18p11.32, 9q22.33, 15q26.1, 5q33.3, 17q21.32, 3q22.1, 13q13.1, 16p13.2, 1q31.3, 5q11.2, 20q11.22

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BTY Panel

Localizzazione cromosomica: HLD48, HLD114, HLD304, HLD131, HLD38, HLD82

‍Chromosomal localization: 2q11.2, 17p13.2, 9q34.3, 7q36.2, 1q32.2, 7q21.3

Caratteristiche

• Genotipizzazione semplice e diretta
• Flusso di lavoro semplificato per genotipizzazione e monitoraggio su un'unica piattaforma
• Esecuzione su sistemi dPCR standard
• Automazione da medio ad alto rendimento possibile a seconda del sistema dPCR

Il kit Mentype® DigitalScreen è uno strumento di ricerca per l'analisi qualitativa iniziale del genotipo di due campioni di DNA umano. I dati ottenuti consentono la misurazione di campioni di DNA misti, come nella valutazione del chimerismo, utilizzando il Mentype® DigitalQuant. Questa combinazione semplifica l'intero processo di genotipizzazione e monitoraggio su un’unica piattaforma.

Biomarcatori

• Polimorfismo di inserzione/delezione (DIPs o INDELs)
• SRY
• Gene di riferimento

Mentype® Digital sfrutta la tecnologia avanzata della PCR digitale ad alta sensibilità che consente la quantificazione assoluta dei campioni di chimerismo. La PCR digitale è caratterizzata dalla suddivisione del campione in una moltitudine di nanodrops. Ogni compartimento separato contiene nanolitri del campione di interesse e durante processo di PCR funge da camera separata per l’amplificazione dei campioni. In base al numero di copie delle molecole di DNA target presenti in ciascuna goccia (zero, una o più copie), viene generata una grande quantità di replicati per ogni ciclo di PCR. Utilizzando la statistica di Poisson è possibile determinare con gran precisione il numero assoluto di copie iniziali. Dopo la PCR, ogni compartimento viene automaticamente analizzato e classificato come frazione positiva o negativa. La PCR digitale, utilizzando il rilevamento a punto finale del prodotto di amplificazione, riduce l'importanza dell'efficienza dell'amplificazione ed elimina la necessità di curve di calibrazione.

Mentype® DigitalScreen è una piastra di screening e consente l'identificazione rapida di polimorfismi biallelici di breve inserzione/delezione (INDELs). I marcatori identificati possono essere utilizzati per la successiva quantificazione del DNA con il kit Mentype® DigitalQuant.

Caratteristiche

• Quantificazione assoluta senza necessità di replicati tecnici
• Quantificazione del rapporto DNA target fino allo 0,1 %
• Esecuzione su sistemi dPCR standard
• Applicazione per esempio in chimerismo, rigetto del trapianto o ricerca sui prodotti cellulari

Dopo la genotipizzazione iniziale, il Mentype® DigitalQuant viene impiegato per una precisa quantificazione dei rapporti di DNA, come negli studi sul chimerismo o sui trapianti. Questo approccio utilizza la tecnologia PCR digitale e offre una maggiore sensibilità e ripetibilità grazie ad una quantità di DNA ottimizzata.

Biomarcatori

• Polimorfismo di inserzione/delezione (DIPs o INDELs)
• SRY
• Gene di riferimento

Mentype® DigitalQuant utilizza la tecnologia PCR digitale ad alta sensibilità che consente la quantificazione assoluta dei campioni di DNA. Una caratteristica della PCR digitale (dPCR) è la suddivisione del campione in una moltitudine di nanodrop.  Ogni compartimento separato contiene nanolitri del campione di interesse e durante processo di PCR funge da camera separata per l’amplificazione dei campioni. In base al numero di copie delle molecole di DNA target presenti in ciascuna goccia (zero, una o più copie), viene generata una grande quantità di replicati per ogni ciclo di PCR. Utilizzando la statistica di Poisson, è possibile determinare con grande precisione il numero assoluto di copie iniziali. Dopo la PCR, ogni compartimento viene automaticamente analizzato e classificato come positivo o negativo. La PCR digitale, utilizzando il rilevamento a punto finale del prodotto di amplificazione, riduce l'importanza dell'efficienza dell'amplificazione ed elimina la necessità di curve di calibrazione.

I test Mentype® DigitalQuant sono stati progettati per l'analisi quantitativa dei loci DIP identificati (polimorfismi di delezione/inserzione, INDEL). Questi saggi comprendono un pannello di 29 alleli DIP differenti e vengono forniti in miscele duplex. Ogni mix include sia la ß-globina come riferimento attivo (REF) che l'SRY come marker specifico del cromosoma Y. Inoltre, è disponibile una combinazione di SRY/REF come test completo.

Caratteristiche

• Ampia applicabilità - Nessuna limitazione nei contesti di chimerismo misto
• Maggiore probabilità del 10% di individuare marcatori altamente informativi (marcatori ad alta polimorfismo)
• 6 marcatori STR validati dal Consorzio Europeo di Analisi del Chimerismo
• Basso input di campione per la massima sensibilità (1-3 %)

Mentype® Chimera® PCR Amplification Kit è stato progettato come una soluzione multiplex per il monitoraggio del chimerismo dopo il trapianto di cellule ematopoietiche. Mentype® Chimera® offre una soluzione semi-quantitativa affidabile per l'analisi del chimerismo. Utilizzando Mentype® Chimera®, è possibile eseguire la genotipizzazione con solo 200 pg di gDNA, permettendo la rilevazione di frazioni del ricevente fino all'1-3% durante il monitoraggio. Pertanto, il kit si conferma come uno strumento versatile ed efficace per il monitoraggio del chimerismo.

Biomarcatori

• Amelogenina X
• Amelogenina Y
• D2S1360
• D3S1744
• D4S2366
• D5S2500
• D6S474
• D7S1517
• D8S1132
• D10S2325
• D12S391
• D18S51
• D21S2055
• SE33 (ACTBP2)

Il trapianto di cellule staminali ematopoietiche allogeniche (HSCT) è un'opzione terapeutica per pazienti affetti da malattie ematologiche benigne e maligne, come la leucemia. Per monitorare l'esito del trapianto e rilevare segni precoci di rigetto, si utilizza l'analisi del chimerismo per determinare la proporzione di cellule ematopoietiche provenienti dal donatore rispetto a quelle del ricevente. A seconda del successo del trapianto, possono svilupparsi diverse forme di chimerismo ematopoietico (completo, misto o perdita). Sono disponibili diversi approcci per l'analisi del chimerismo, inclusi ibridazione fluorescente in situ (FISH), polimorfismi dei frammenti di restrizione (RFLP), analisi dell’emocromo e metodi basati su PCR. Attualmente, l'amplificazione PCR di polimorfismi a corte ripetizioni in tandem (STR) è considerata lo standard per l'analisi del chimerismo. Per una valutazione efficace del rigetto del trapianto, è fondamentale eseguire l'analisi del chimerismo a intervalli regolari e immediatamente dopo l'HSCT allogenico